L'école de Marsannay-le-Bois appelée "Ecole Primaire du Levant"  est composée d'une classe élémentaire à plusieurs niveaux et de 2 classe de maternelle.
L'école fonctionne en RPI (Regroupement Pédagogique Intercommunal) avec la commune de Chaignay.
La maternelle est encadrée par un SIVOS (Syndicat  Intercommunal à Vocation Scolaire) de Marsannay-le-Bois /Chaignay qui gère les deux bâtiments de l'école maternelle ainsi que le travail des ATSEM qui y sont rattachées.

Les enfants inscrits à l'école peuvent bénéficier d'un service de repas le midi et d'une garderie périscolaire gérés par la COVATI.